クリーンルームは恒久的設備になり、断熱性能・温調機能・差圧管理など高機能です。導入には設置工事が必要で、イニシャルコストと工期（月単位）がかかります。 クリーンブースはイニシャルコストがクリーンルームに比べて安価です。簡易クリーンルームとして使われたり、部屋の一部のクリーン化や、移設や改造が可能ですので、一定期間だけの設置などフレキシブルな使い方ができます。
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